La microbiota humana es un complejo ecosistema de más de 10^14 bacterias y otros seres vivos, como virus bacteriófagos y levaduras, cuya función es mantener la diversidad de especies. En conjunto, se calcula que en cada ser humano residen a nivel del tracto digestivo entre 10 y 100 trillones de microorganismos. El microbioma es el conjunto de genes de la microbiota, que supera unas 100 veces el número de genes humanos. Este genoma colectivo da lugar a funciones que de forma aislada no podrían tener lugar. Se trata por tanto, la microbiota, de un ecosistema simbiótico con el ser humano, que interviene de forma esencial en el metabolismo de nutrientes y medicamentos, en la regulación de vías metabólicas, la motilidad intestinal, el desarrollo del sistema inmune de mucosas y sistémico, el mantenimiento de la integridad del epitelio intestinal, respiratorio y cutáneo, la producción de vitaminas y micronutrientes y metabolitos neuroactivos. La microbiota humana depende del ambiente, la alimentación, factores externos como el uso de medicamentos, de la edad,..., y varía entre individuos dentro de un cierto rango. Uno de los campos de investigación llevados a cabo por ESCI se centra en la relación entre microbiota y sueño, aspectos especialmente importantes en las primeras (colonización) y últimas (disbiosis) etapas de la vida.